经过百余年的发展，从“强迫运动”“五项试验”，到“劳卫制”国防体育，再到现如今贯穿本科教育全过程的体育教学模式，体育部始终在努力探索前进。目前清华坚持本科四年开设体育课，同时明确规定本科生必须测试长跑（男生3000米、女生1500米），体育课不及格或未通过游泳测试均不能毕业。体育课开设了近50个课项，课程涉及竞技体育（奥运项目）、休闲体育、民族传统体育和体疗课等各类项目，还为研究生开设了体育选修课。2004年《大学体育》被评为国家级精品课程，2018年获得国家级教学成果奖。